J.J. Abrams Star Trek filmjének előzményei képregény formájában jelentek meg idén január és április között, négy számban, Star Trek: Countdown (Visszaszámlálás) címmel. A történetet a film forgatókönyvírói Alex Kurtzman és Roberto Orci írták meg, céljuk pedig azon kívül, hogy részletesebben bemutassák a film gonoszának, Nero-nak a motivációit, az volt, hogy a lehető legjobban összekössék azt az eddigi Star Trek-univerzummal. Mivel a képregényeket valószínűleg kevesen olvassák el, ezért azok számára akik jobban megértenék a film cselekményét és a szereplők motivációit, most összefoglaljuk, hogy mit is lehet tudni a film előtörténetéről.
Nyolc évvel azután járunk, hogy az Enterpise-E legénysége legyőzte Shinzont, mindannak, amit a tizedik filmben, a Star Trek Nemezisben láthattunk. Nero, a romulán bányász hajójával, a Naradával és legénységével a Hobus rendszer egyik bolygóján bányásznak, amikor észreveszik, hogy a bolygó a csillag változásai miatt destabilizálódik és hamarosan fel fog robbani. A romulán tanácsot, a Romulus vulkáni nagykövete, az élete végén járó Spock arra figyelmezteti, hogy megfigyelései szerint a Hobus csillag hamarosan szupernóvává alakul, ami nem csak a környező csillagrendszereket veszélyeztetheti, hanem az egész Romulán Birodalmat. Terve szerint a ritka, Nero által is bányászott decalithiumból állítaná elő a Vörös anyagnak nevezett katalizátort, amivel a katasztrófa bekövetkezése előtt fekete lyukká változtatná a Hobust, így az összeroskadna. Mivel a Vörös anyag csak vulkáni kísérleti technológiával állítható elő, a romulánok cselt sejtenek és megtagadják a kérést.
Nero azonban hisz Spocknak és cselekedni akar. Felajánlja, hogy kibányássza a szükséges decalithium mennyiséget, és azt a Vulkánra szállítja. A titokban bányászó Naradát közben remanok támadják meg, akiket az Enterprise-E ver vissza, élükön a B-4 testében újjászületett Data kapitánnyal. A két hajó megérkezik a Vulkánra, ahol Picard a Föderáció nagyköveteként fogadja őket. Számításaikat ugyanakkor keresztülhúzza, hogy a vulkáni tanács sem kész arra, hogy kiszolgáltassa a Vörös anyag technológiáját a romulánok számára. A feldühödött Nero visszaindul a Romulus bolygóra, hogy az időközben megkezdett evakuációban segédkezzen. A Hobus azonban idő előtt szupernóvává válik és Nero már csak annak lesz szemtanúja, ahogy szülőbolygója a terhes feleségével együtt megsemmisül.
A Romulán Birodalomban eluralkodik a káosz. Nero hajójával felveszi az elpusztult bolygóról éppen csak megmenekülő romulán vezetőket, de tétlenségükért megöli őket és magához veszi a birodalom irányítását jelképező lándzsát, a Debrune Teral'nt. Előtte azonban a tancsátagok elárulják a titkos romulán bázis helyét, így Nero-ék oda tartanak. Itt a Naradát felszerelik kísérleti fegyverekkel és a Borgtól lopott technológiákkal, hogy bosszút állhasson a Vulkánon.
A Romulus pusztulása észre téríti a vulkáni tanácsot és a Föderációt, így Spock folytatja a Hobust fekete lyukká alakító tervének megvalósítását. A Vörös anyag célbajutattásához egy különleges körülményeket is elviselő hajót, a Medúzát hozza a Vulkánra a tervezője, Geordi La Forge. Spock hamarosan elindula a Hobus rendszerbe, hogy végrehajtsa küldetését, de tart attól, hogy Nero bosszúból megpróbálja megakadályozni, hogy sikerrel járjon.
Mindeközben Nero-t a klingon hadsereg próbálja feltartóztani, kevés sikerrel. Worf tábornoki rangban vezeti a flottát, de amikor minden kötél szakad, megpróbálja a Naradát egy csapat harcossal megszállni és közelharcban elfogni Nero-t. Worf nem jár sikerrel és súlyosan megsebesül. Nero a helyszínre érkező Enterprise-t is megpróbálja elpusztítani. Felajánlja, hogy áttranszportálja a sebesült Worfot, hogy az Enterpise leeressze a pajzsait. Mivel azoban a hajó a csel ellenére is keményebb diónak bizonyul, mint várta, inkább Spock után indul, hogy megakadályozza, hogy a Hobus lecsillapításával megmentse a Vulkánt és az egész Föderációt. Spock azoban még a Narada érkezése előtt sikerrel jár és a Hobus fekete lyukká roskad össze. A létrejövő szingularitás azonban, ahogy azt Spock várta, magába szívja őt, valamint a Spockot még mindig őrült bosszúvággyal üldöző Nero hajóját is.
Spock és Nero hajói tehát elvesztek valahol a tér-időben. Az új filmben a Narada váratlanul felbukkan a múltban, és érkezésével törvényszerűen megváltoztatja az eddigi idővonalat. Azoban Spock sem tűnt el végleg, és meg kell próbálnia legalább részben helyrehoznia a kataklizmát, Nero megállításával.